Multiomiczny atlas mózgu naczelnych został udostępniony w otwartym dostępie

Xiaoqun Wang z Chińskiej Akademii Nauk wraz ze współpracownikami przedstawił multiomiczny atlas mózgu sześciu gatunków naczelnych, w tym człowieka. Aby go stworzyć, naukowcy wykorzystali własne narzędzia i bazy danych: PubMed, Gene Expression Omnibus (GEO), UCSC Cell Browser, NeMO, Descartes, EMBL-EBI oraz Allen Brain Map, aby zebrać i zintegrować publicznie dostępne wyniki badań transkryptomicznych pojedynczych komórek oraz przestrzennych analiz transkryptomicznych i epigenomicznych mózgu. Uzyskane macierze ekspresji genów porównano z genomami referencyjnymi człowieka, szympansa, goryla, makaka rezus, makaka krabożernego i małpy łownej. Wyniki opublikowano w czasopiśmie „Nucleic Acids Research”.

Przeanalizowane i zintegrowane dane zebrano w atlasie MAPbrain. Zawiera on dane dotyczące 21 milionów komórek z 38 kluczowych regionów i 463 podregionów mózgu we wszystkich okresach rozwoju embrionalnego i postnatalnego (łącznie 164 punkty czasowe). Nawigacja po atlasie umożliwia badanie zarówno pojedynczych komórek, jak i całego transkryptomu i epigenomu, analizę markerów molekularnych specyficznych dla komórek różnych typów i etapów rozwoju oraz porównywanie profili ekspresji genów w różnych częściach mózgu i u różnych gatunków naczelnych. Użytkownicy mogą przesyłać własne dane na platformę internetową i je analizować. Atlas jest dostępny w otwartym dostępie.

Od DrMoro

Originalus tekstas
Įvertinkite šį vertimą
Jūsų atsiliepimai bus naudojami „Google“ vertėjui tobulinti
Negalime obsługuje te formy
Saugos sumetimais nepateikeit informacije tokio tipo formaje, kai uyutikoku „Google” vertėją.
SupratauPrzejdź do oryginalnego adresu URL