Multiomiczny atlas mózgu naczelnych stał się ogólnodostępny

Xiaoqun Wang z Chińskiej Akademii Nauk i jego współpracownicy przedstawili multiomiczny atlas mózgu sześciu gatunków naczelnych, w tym ludzi. Aby go stworzyć, naukowcy wykorzystali własne narzędzia i bazy danych PubMed, Gene Expression Omnibus (GEO), UCSC Cell Browser, NeMO, Descartes, EMBL-EBI i Allen Brain Map, aby zebrać i zintegrować publicznie dostępne wyniki badań transkryptomowych poszczególnych komórek, przestrzennych analiz transkryptomowych i epigenomowych mózgu. Uzyskane macierze ekspresji genów porównano z genomami referencyjnymi ludzi, szympansów, goryli, makaków rezusów, makaków krabożernych i małp łownych. Wyniki opublikowano w czasopiśmie Nucleic Acids Research.

Przeanalizowane i zintegrowane dane zostały zebrane w atlasie o nazwie MAPbrain. Zawiera on dane dotyczące 21 milionów komórek z 38 kluczowych regionów i 463 podregionów mózgu we wszystkich okresach rozwoju embrionalnego i postnatalnego (łącznie 164 punkty czasowe). Nawigacja po atlasie pozwala badać zarówno pojedyncze komórki, jak i transkryptom i epigenom jako całość, brać pod uwagę markery molekularne specyficzne dla komórek różnych typów i różnych stadiów rozwoju, porównywać profile ekspresji genów w różnych częściach mózgu i u różnych gatunków naczelnych. Użytkownicy mogą przesyłać własne dane na platformę internetową i je analizować. Atlas jest dostępny w otwartym dostępie.

Od DrMoro

Originaltext
Diese Übersetzung bewerten
Mit deinem Feedback können wir Google Übersetzer weiter verbessern
Ten formularz nie jest obsługiwany
Aus Sicherheitsgründen solltest du keine Informationen über diese Art von Formular senden, während du Google Translate verwendest.
DobraDo oryginalnego adresu URL